Dès sa création, Eco-systèmes a pris le parti de s’engager fortement en faveur de l’économie sociale et du ré-emploi, activité déjà gérée depuis de longues années par ces acteurs. Deux accords nationaux ont été signés en 2005 avec Emmaûs France et le réseau Envie. D’autres contacts sont en cours afin de conclure des accords du même type.

Pour ces deux premiers accords, Eco-systèmes s’est fixé pour objectif de protéger les emplois existants et si possible de contribuer à les développer. Par ailleurs, Eco-systèmes a garanti à ses partenaires l’accès à un gisement de qualité, au plus près du consommateur, afin de pouvoir reprendre des équipements en bon état. Cette condition facilite beaucoup la remise en état, et permet de refaire, en moyenne, un nouvel appareil avec 5 appareils usagés. Ces accords comportent un volet économique avec un barème de soutien financier pour contribution à la collecte.

Par ailleurs, Eco-systèmes a ouvert ses appels d’offre à toutes les entreprises d’insertion souhaitant faire une proposition, en concurrence complète avec les opérateurs privés. Suite à ces appels d’offre, l’économie sociale représente 25 % de l’activité logistique d‘Eco-systèmes et 18 % du traitement.